由于织田军的本阵、侧翼皆遭到突袭，以及织田军总大将织田信长因右腿中箭坠马，在赤母衣众的拼死掩护下退往尾张中部重镇末森城进行救治。
随着六角军的不战而逃，以及织田信长的退出战场，使得织田军各部顿时陷入了群龙无首的状态。
野口政利（平手政秀之弟）、平手久秀（平手政秀之子）、堀尾泰晴、山内盛丰、前野时之、平野宗房等将也是无心与上杉军继续交锋。他们可不愿将自己的小命丢在这岩崎原上，便纷纷率马廻众逃离战场，以免被上杉军讨取。
可此时的上杉军经过拼死血战已经取得优势，并在总大将八条定繁的号令之下全线发起反击，直扑织田军各部后撤的军势。
只见越来越多的织田军丧失战意，各自丢盔弃甲，四散而逃。
柴田胜家、森可成、池田恒兴、下方贞清等织田家猛将们倒是反应不慢，很快就判断出己方已然败北，不再恋战，当即率本部军势向岩崎原的西北方进行突围。
大风阵阵，尘土飞扬，骄阳蒙晕。
岩崎川的西岸，上杉、织田两军在这秋风之中不断搏杀，战场之上，尸骸交错，凄凉无边，鲜血也将岩崎川染成了红色。
这时，丹羽氏职在岩崎城三之丸的箭橹上发现上杉军已经完全占据了主动，并将织田军打得节节败退后，当即下了箭橹，翻身上马，在马廻众的簇拥下，率三百余军势出城驰援友军。
只见岩崎丹羽势在丹羽氏职的率领下，一齐发出呐喊声，纷纷冒死突进，喊杀声更是响彻天地，使得上杉军各部的士气进一步提升。
丹羽氏胜、上田近正兄弟二人自恃勇猛，一手持太刀，一手持木楯，一路斩翻诸多织田军的武士、足轻、农兵。他们身旁的上杉军是深受感染，也奋力上前助战。
随后，混乱很快就蔓延至尚未败退的织田军各部之中。
饭尾定宗、织田信房、佐久间盛重、佐佐政次等将皆是织田家中的久经沙场之人，知晓大势已去，再无反转的可能。在他们眼中，击溃并不是什么可怕的事情，只要不被讨取、歼灭，那么待战后收拢溃军，再休整一段时间，就又能恢复元气了。
然而，八条定繁可不打算轻易放过这个一举歼灭织田家有生力量的大好时机。因为，织田家在尾张、美浓、三河、伊势等国的战事中多次被击败，在收拢溃军，以及依靠其本就雄厚的财力，又能再度纠集数千至上万规模的军势，故而战事经久不息。
八条定繁此时意图将织田军溃军的大部分进行歼灭，就是汲取了这个教训。于是，他就令长井为实火速率左控鹤备的三百名骑马武士抢占竹之山、宝林寺两地，将织田军溃兵逃往下社城的必经之路截断。
才退入宝林寺中不久的织田信张（织田宽廉，织田藤左卫门宽故之子，织田信康女婿，其母为斯波义达之女玉堂殿）、织田常知（织田信张之弟）兄弟还没喘过一口气，就发现寺外尘土飞扬，只见上百名骑马武士正杀气腾腾的向自己冲来。
自知无路可逃的织田信张、织田常知兄弟就只好命麾下马廻众前去阻击，他们二人则是退入大殿之中互刺而亡，以免落得个被俘受辱的下场。
与此同时，八条定繁在率军击溃织田信时、织田信实两部，并将织田信时、织田信实二人讨取以后，就与丹羽氏职合兵一处，对织田军的溃兵进行持续追击。
如今的织田军已彻底崩溃，对上杉军的追击是毫无还手之力，更跑不过上杉军的战马，等待他们的将是上杉军手中的屠刀。
之后，上杉军是一直追击到末森城外才停下了脚步。
经此一役，织田信广、织田信时（织田信长之叔）、织田信实（织田信长之叔）、织田信正（织田元贞，织田信长之叔）、饭尾定宗、织田信房、织田伊贺守、佐久间盛重、佐佐政次、丹羽氏秀、梶川高秀、冈田善长、塙直政、那古野胜泰、林光利、加藤勘三郎、小关三五郎等诸多织田家有名武将先后在混战之中被上杉军讨取，而参阵的织田军武士、足轻、农兵、阵夫等被上杉军讨取者也达到了三千九百余人，还有不少人溺毙于岩崎川、植田川、矢田川等河流之中。
织田信清、柴田胜家、森可成、池田恒兴、下方贞清、津川义冬、林秀贞、织田信包等人倒是没有与织田信长选择同样的逃亡路线，反而是率各自的马廻众一路北上，直至北尾张的丹羽郡境内，这才侥幸从上杉军的屠刀之下逃得一命。但他们也没好到哪里去，几乎是人人挂彩，颇为狼狈。
毫无疑问，织田家此次在岩崎原之战的损失是仅次于织田信秀时期的井之口之战（加纳之战），且惨烈程度是有过之而无不及。
先前，织田家在围攻鸣海城的失利，也只是丢了不少粮草辎重，败得难看一些，至少伤亡还没有超过三千五百人以上的规模。
此次岩崎原之战，织田家不单单是丢弃了全部携带的粮草辎重，更是折损了包含织田信广、织田信时、织田信实、织田信正、织田信张、织田伊贺守、饭尾定宗等诸多同族重臣。
从精神层面来说，织田家的军心无疑再一次遭到
重创。从岩崎原逃回织田领的溃兵更是声称上杉军即将要大举发起侵攻，弄得是人心惶惶不可终日，就连织田信长本人都动了逃往织田弹正忠家原先的本据胜幡城，差点儿就放弃了清州城、那古野城等重镇要地，后来才发现是虚惊一场。
至于原先被织田信长用于阻遏北条家前来驰援的残余相野山砦守军，他们的运气并不好。
失去了大将织田信广节制，以及相野山砦陷落，织田与三郎、伴正林、布施五介等人就盘算着率部北上逃入丹羽郡的犬山织田领境内。
可是，还没等织田与三郎、伴正林、布施五介等人抵达春日井郡的中部，麾下军势已经逃离大半，途中还多次遭到了落武者狩。
最后，仅有伴正林、布施五介这两名出身于近江甲贺郡的武士成功逃入了丹羽郡境内。而自织田与三郎以下五十余人，皆在途中遭到了落武者狩而殒命。