虽说伊势贞孝、伊势贞良父子寡不敌众，于船冈山之战中迅速败亡。但在战后，足利将军家、三好家几乎是搜遍了山城、摄津两国，都没能找到任何一名伊势贞孝的家眷。
因为，多罗尾光俊的正室伊势御前是伊势贞孝的养女（伊势贞运之女）。
早在伊势贞孝正式举兵之前，就将家眷暗中送往多罗尾家的居城小川城之中，因此伊势伊势守家并没有遭到太大的打击。
等教兴寺之战的结果传至若狭境内，一色义幸、神余亲纲、河田元亲、斋藤家信等上杉家诸将的反应则是并不相同。
作为攻略若狭一国的总大将，一色义幸对此是感到难以置信的。照理说金吾畠山家在近畿诸国之中的影响力并不亚于三好家，且家格还是位列三管领、室町二十一屋形之一，先前还在久米田之战中接连讨取三好实休、野口冬长、三好政成、篠原康范、小笠原长行、镰田光久、西条长纲、伊泽赖俊等多名三好家重臣，怎么可能会在教兴寺之战中一战被三好军打得惨败？
而身为先手大将的斋藤家信倒是直接痛骂金吾畠山家、伊势伊势守家上下一番，认为这两家只是尸位素餐的武家名门。就连杂贺众、根来众等擅长使用铁炮的佣兵集团都明确支持金吾畠山家，竟然还会遭到如此惨败。
至于提起伊势贞孝，斋藤家信更是气不打一处来。
作为长期世袭罔替政所执事之职的有力幕臣，还是精通小笠原流的弓术、骑术，甚至还与不少公家交好，此次伊势伊势守家不仅没有获得麾下庶子家的支持，就连政所之中的寄人（能参与政所评定的役人）、公人（政所的杂用官吏）都站在了其对立面。使得伊势贞孝仅仅召集到不到五百人的军势，就于船冈山之战中被十六倍以上的足利·三好联军击败。
以至于近畿诸国的局势再度有利于三好家一方，让上杉家一方陷入了一定的被动。
不单单是斋藤家信对金吾畠山家的表现是极为失望，就连神余亲纲、河田元亲等人也是深有同感。
那可是近四万规模的大军，竟然能在一天之内就被三好军一举击溃。就算是四万头猪让三好军抓，一天都不可能抓完。
而且，金吾畠山军在教兴寺之战的惨败可不单单祸害自家重臣汤川一族，以及伊势贞孝。
由于孤立无援，且弹压了伊势贞孝举兵的近万足利·三好联军正在朝着摄津进军后，三宅城城主三宅国村因惧怕遭到三好家大军的讨伐而直接带着家眷，弃城逃往一向宗总本山石山本愿寺。
细川晴元一方的丹波有力国人领主宇津赖高因救援伊势贞孝失败，在返回居城宇津城途径爱宕山之际，遭到了内藤宗胜的伏击。
在猝不及防之下，宇津势被讨取了四百余人，宇津赖高更是只身逃回了宇津城。
先前支持金吾畠山家的细川政清、松浦虎、小谷政种等反三好家的和泉诸将们在战后也遭到了三好家的清算——细川政清、松浦虎等人力不能敌，放弃领地逃往纪伊去寻求金吾畠山家的庇护；小谷政种在自己的居城小谷城坚守了半个月后，因孤立无援，被三好长逸、三好长房、三好长朝等人以一万余军势攻落，自小谷政种以下三百余人被讨取······
从表面上看，输家就只有金吾畠山家一家。可实际上，真正的赢家却并非三好家，反而是上杉家。
三好家虽然在教兴寺之战后，成功夺回了和泉、河内、大和三国之中的失地，并一度攻入了北纪伊的伊都郡、那贺郡等地，但在三好军主力分兵驰援三好义兴部，以及回援摄津一国后，畠山高政在收拢了败军，并再度联合杂贺众、根来众，又接连夺回了北纪伊的伊都郡、那贺郡等地的控制权，将三好家的势力完全驱逐出了纪伊一国。
这就使得，三好家在击退并重创了金吾畠山家之后，并没有做到治下领国的扩张，仅仅只是保全了原先治下领国的范围。
经过久米田之战、教兴寺之战后，三好家不仅折损了三好实休、野口冬长、三好政成、筱原康范、小笠原长行、镰田光久、西条长纲、伊泽赖俊等诸多同族、谱代重臣，还使得治下的阿波、讃岐、东伊予三地出现了巨大的政治真空，急需三好长庆、三好义兴父子去稳定局面。
反观上杉家，趁着三好家与金吾畠山家交恶之际，不断对若狭一国进行蚕食鲸吞，并在夺取后濑山城后，厚待前任管领、京兆细川家家督细川晴元，让原先倒向三好家一方的丹波诸将大都产生了动摇。
一旦上杉家完全兼并了若狭一国，并获得半数丹波诸将的支持，那么上杉家只需要联合金吾畠山家，就能从南北包夹三好家治下的南丹波、山城、摄津、河内、和泉、大和等地。
而且，上杉家还利用自身影响力，让伊势北畠家、伊势楠木家、千种家、志摩水军众、金吾畠山家等伊势、志摩、纪伊三国的不少大名、国人领主们先后臣从，使得上杉家兵不血刃的就将版图延伸至伊势、志摩、三国之中。
不仅如此，上杉家还在尾张一国多次重创织田家，并寝反了不少美浓国人领主，使得东尾张一带不再成为飞地。
可以说，
三好家虽居胜势而不得实利，上杉家虽危而不堕，这倒是个颇为奇怪的现象。
这也让世人明白一个道理：叫嚣得再凶也不过尔尔，而闷声发大财的才是最大的得利之人。
对于上杉家来说，金吾畠山家、伊势伊势守家遭到三好家的重创，其实并不算什么。毕竟，这两家都不是上杉家的嫡系。
若想做到静谧天下，必须有着成熟而高效的军政班底、一支强大的君主直属军队，以及控驭天下的威望。
如果不能满足以上条件，那么即使建立了新的秩序也无法面对内外力的冲击，足利将军家就是最好的例子。