崇祯十二年五月十五日，已经收复南都，成功入主应天府近七天的崇祯帝以朝廷的名义向全国下令，正式废黜南都朝制。
并将原应天府改名为南京府，都城应天城改为南京城。
同年六月九日，原南都朝众文武官员解散，一批卸职归乡，一批降职北调。
只有为数不多的几人被崇祯帝以协助破城有功为名，从原南都朝官改任为各地实权地方官。
其中，原南都吏部尚书郑三俊被改任为南京知府，赐文勋‘正治上卿’，赏阶‘荣禄大夫’，提衔‘东阁大学士’，提督南京及整个南直隶14府政务。
原南都太仆寺正卿冯元彪调任江西省南昌府知府，赐文勋‘资治少尹’，赏阶‘亚中大夫’，提衔‘谨身殿大学士’，提督南昌及整个江西省13府政务。
原湖广参政黄公辅升任‘湖广承宣布政使司布政使’，赐文勋‘正治卿’，赏阶‘资善大夫’，提衔‘武英殿大学士’，提督两广南北16府政务。
六月二十三日，以大明忠勇侯马祥麟为主，大明宁远团练总兵兼平乱先锋官吴三桂为辅的十万北地左路南军。
以大明威通侯秦翼明为主，通州总兵刘泽清为辅的五万北地右路南军。
以及以在山阳投降的左良玉之子左梦庚为主、副将金声桓为辅，由精锐降军组成的五万平贼先锋军。
三军总计二十万大军，在正式更名为南京府的原大明应天府休整月余后，分别从南京府东、南、西三面出发，直扑南直隶南部各府。
六月二十五日，受弘光朝统辖的南直隶庐州、安庆、池州、宁国、徽州、太平、镇江、常州、苏州松江等10府上书请降。
崇祯帝以神谕的方式受降，并昭告天下南直隶正式光复。
六月三十日，以马祥麟、吴三桂为主的十万左路北地南军过南直隶庐州、安庆、池州西南三府，直入与南直隶西南相接壤的江西饶州、九江两地。
并与盘踞在当地翻阳湖内，由原弘光朝溃军、翻阳湖当地匪贼组成的三十万贼军接战。
由于当地水路复杂，且马祥麟、吴三桂等人率领的都是北地骁锐，对水势不熟，所以攻势受阻，一时僵持不下。
七月一日，消息传回南京府，坐镇南京的崇祯帝急命大明镇海大将军郑成功亲率五万水军顺江入江西接应支援。
同日，以左梦庚、金声桓为主五万平贼先锋军过南京府以南的广德州，直入广德州南部浙江。
并于次日凌晨在浙江北部湖州府一代与盘踞在当地作乱的数万乱军接战。
最终斩首万余，降三万余人。
正在杭州府劫掠的张献忠得到消息，率二十万贼军主力南逃。
左梦庚为防止张献忠流窜，率大军南下追杀，却被张献忠以诱敌深入之计在杭州府以北‘临平山’境内埋伏。
五万先锋军，两万降军，总计约七万余人被困。
七月三日，求援信传回南京府，崇祯帝命盘踞在浙江东部沿海一代负责封锁海域的大明南安伯郑芝龙率十万水师由杭州湾入江救援。
七月五日凌晨，郑芝龙所率十万水师进入临平山一代，并与张献忠麾下布防的贼军接战。
同日，被困于临平山内的左梦庚、金声桓等人配合郑芝龙发起决死性冲锋。
最终以自身死伤万余人的惨重代价从包围圈中杀出，并在郑芝龙的配合下反败为胜。
战后，张献忠被活捉，并于数日后凌迟处死。
其麾下二十万贼军除少数溃逃不知所踪外，近十万余人在坐船北上献俘时突遭风浪，全部坠入海中无一生还。
至此，为祸大明张献忠覆灭，浙江贼乱平定。
而就在马祥麟、左梦庚所率的西、南两路大军各自攻城略地时，由秦翼明、刘泽清率领的五万北地右路南军也在南直隶以东的苏州府太湖境内遇到了由原弘光朝残军与当地匪贼联合组成的十余万贼军的突然攻击。
由于事出突然，虽然两人率领的五万大军都是能征善战的精锐，但也被太湖匪贼的突然袭击死伤惨重。
在付出近数千人的伤亡后，两人不得不率军北撤终止南下计划。
事后，秦翼明、刘泽清两人率余部四万余人在太湖以东的浒野关与太湖贼军展开拉锯战。
可惜，两人的南军都是陆上好手，对水势并不熟悉，而盘踞在太湖的贼军战阵不行，但却熟悉水性。
所以双方你来我往下，一时竟奈何不得。
…
崇祯十二年七月十日，南直隶东南地区，松江府松江城。
夜。
“……爹，你就别拎着了，赶紧想想办法啊，刘大他们撑不了多久的。
那群人是什么德性你儿子我最清楚，平日里飞鹰遛狗玩女人他们在行，行军打仗这种事他们根本做不来的。
现在是秦翼明他们人少，一旦妖帝调遣郑家的水师过来，或者派兵支援，他们恐怕就要投降了。
我不想死，更不想被那妖帝捉去剥皮抽筋啊爹！”
“闭嘴，哭什么哭！堂堂大明左军都督府左都督，正一品大员，竟然在这里做着女儿姿态！
我徐有庆怎么生了你这么个窝囊废！
我算是知道徐弘基手握百万大军为什么还会输了，有你这等人充任军将，不输才怪！”
“爹……”
眼泪汪汪的看着眼前这个糟老头子，原大明南都五军都督府之左军都督府左都督，后来因为朱伟光改制顺天府五军都督府而害怕朱伟光裁撤南都五军都督府。
最终在崇祯十一年九月初一徐弘基唆使熊文灿等人启禀造反时，一起率军加入。
现在因为南都失守时及时帅军南逃捡回一条命，并在路过太湖时将麾下数万叛军扔在太湖布防，自己则一个人逃窜回松江老家的徐阶曾曾孙‘徐本高’一脸委屈。
他面前，徐家当代家主，按族谱，应该是徐阶长房曾孙的‘徐有庆’则恨铁不成钢的瞪了他几眼，转头看向屋内其它几个朝官后嗣。
“以老夫看，我等已经大势已去，眼下唯一的活路，恐怕就剩下逃了。”
“逃？”
他面前，天启朝东林六君子之一顾大章之子，苏州顾氏当代家主，原是苏州府海商巨头，现在因为秦翼明帅军南下而被徐有庆叫来商议的顾麟生一怔。
与身旁同样出身天启朝东林六君子后嗣，祖上是天启朝名臣左光斗的左氏三兄弟‘左国柱、左国材、左国棅’对视一眼，陷入了迟疑。