用精神力技能，让碇真嗣用近乎身临其境的感觉，体验了一下新剧场版之中自己原本应该经历的事情。
不过，比企谷八幡在最后卖了个关子，并没有将他驾驶的初号机和碇源渡驾驶的十三号机对决的最终结果，以及人类补完计划的结局。
当碇真嗣满脸震撼地询问比企谷八幡，那些是不是真的时候，比企谷八幡只是告诉他，这是某种可能存在的世界线，如果没有他们介入，会不会发展成这样，则交由碇真嗣自己判断。
对于自己的本性，碇真嗣内心其实是很清楚的，碇真嗣试着想象过，如果没有遇到张天志和曹冲，被他们开导、激励，在经历过那么多的打击之后，自己会变成什么样……
就像三号机被使徒侵占的时候，如果没有张天志告诉他，什么都不做的话是无法拯救明日香的，或许他就会一直保持那副站着挨打的状态，最后被傀儡系统控制了初号机，眼睁睁地看着三号机被大卸八块。
还有十四年后的一切……
很奇怪啊，我这样的家伙，明明放着不管就好，为什么大家都对我那么温柔啊……
沉默间，出击的时刻已经到了，现在三台eva上不仅已经搭载了人造的s2机关，不用再担心能源问题，而且背后还安装上了高城沙耶专门为eva制造的飞行装置。
在飞往原第三新东京所在的路上，一直沉默的碇真嗣突然向明日香问道：“明日香，你喜欢我吗？”
“蛤？”
猛然间听到碇真嗣这么一问，明日香不由得一慌，操纵着的二号机在空中一个踉跄，差一点就掉到下方的海里。
好在明日香的驾驶技术足够娴熟，及时稳住了机体，随即带着三分怒七分羞对着碇真嗣道：“你……你这种时候说什么呢？笨蛋真嗣！笨蛋！笨蛋！笨蛋！笨蛋……”
这家伙，这种时候问这种话什么意思啊？难道是那个吗？著名的死亡flag“如果这场战斗能活下来，我就和谁谁谁表白”？这可真是……
就在明日香胡思乱想的时候，身边的初号机再次传来了碇真嗣的通讯：“明日香，三号机实验被使徒侵占的时候，一开始我不愿意动手……
现在我才知道，我那个时候的想法太不负责任了，如果什么都不做的话，只能眼睁睁的看着你遭遇到更痛苦的事情，什么都不做的话，只是不想让自己受到指责而已……”
明日香感觉今天的碇真嗣有些奇怪，不明白他为什么突然说起了这个：“嘛，反正你最后还是救了本小姐，之后又把我从那些家伙手里带走了……也算干得不错，稍微称赞你一下好了……”
“对不起……”
看着一旁的二号机，碇真嗣低声说了一句，明日香被碇真嗣刚才的一番话搞得莫名其妙，因此没能听清楚：“笨蛋真嗣，你刚刚说了什么吗？”
碇真嗣摇了摇头：“接下来的战斗，我们都要加油！”
“哼！那是当然的！”
说起这个，明日香傲然道：“你就等着看本小姐大显身手吧！”
随后，碇真嗣又看向了装载着真希波的三号机：“虽然现在还没有发生那些事，但是……谢谢你了，真希波小姐。”
虽然欧米伽小队暂时没有向碇真嗣等人吐露有关致命游戏的事情，但通过这些日子的相处，碇真嗣对于欧米伽小队所说的话已经是深信不疑。
对于真希波，不管是因为她曾经和自己母亲碇唯的渊源，还是其他什么原因，碇真嗣都很感谢她对自己的温柔。
而绫波丽……
想到绫波丽为他所做的一切，以及另一条世界线中，自己未能成功救出她的遗憾，碇真嗣不由得握紧了拳头。
这个时候，碇真嗣不由得想起了和张天志、曹冲第一场见面的时候，他们问他有没有发自内心想要去做的事情。
现在，碇真嗣心中已经有了答案。
渚薰说，要让他一个人幸福，但碇真嗣觉得，如果这个并不美好的世界也可以被改变的话，那么……我想让所有人，明日香也好、绫波也好、真希波小姐也好、美里小姐也好……当然也包括我自己，都有一个更好的未来。
“马上就要到了！”
高城沙耶站在神行舟的船头，看着不远处海面上的舰队：“不过……看样子这些人不打算就这么放我们过去呢……”
现在出现在他们面前的，是霓虹周围诸国组成的联合舰队，为了防止那个足以彻底终结现在的人类文明的计划完成，也是为了获取有关使徒和eva的秘密，不仅是第三新东京市，霓虹整个国家，都几乎可以说是被其他各国联合监管了起来。
由于之前seele在人类补完计划被公开之后，以迅雷不及掩耳之势动用最后的力量，强行让世界各地的nerv总部转移了所有在建中的eva，因此在组成联军的国家