当上杉清定进驻骏府城休整，并等待岩代、磐城、陆前、陆中等国的己方军势合流之际，先行召开了军议。
在清定看来，此时铁炮已经在扶桑的五畿七道诸国之中普及，为了避免家中之人擅自行动，以及主动向敌方发起一骑讨的请求，他便借着召开军议的机会，重点提醒了一下本庄繁长、善宗次、穴泽氏清、真壁宗干、鹫内秀定等家臣。同时，也还能让其余家臣引以为戒。
随着火器的大规模装备，清定已然认为在战场上一骑讨这样的‘斗将’行为应该淘汰。他认为一军之将的任务是在各自阵中主持大局，而不是像足轻、徒步武士那样在前面厮杀。可就是有些家臣是屡教不改，始终保持着亲自操刀上阵的习惯。
曾经，上杉定虎在率军经略会津四郡之际，就率寡兵于前线探查，结果遭到了芦名家的大军包围。若不是麾下将士用命，她也很难做到全身而退。
事后，清定就专门责备过上杉定虎：“身为一军主将，绝不能鲁莽行事，要慎重行事！本家不愁你不能战斗，而是担心你过于轻敌，你可别忘了令兄华岳光荣与本家对你的期望······”
反过来，清定还不忘表扬了成熟稳重，且出身于足利将军家奉公众的同族老臣八条春纲：“如今家中之人皆骁勇善战，但是平时里老成持重、治军严明、熟悉兵法的，谁也比不上八条日向守。他的职责是在军中运筹帷幄，决不会轻易出阵与敌人进行厮杀。”
可是，清定苦口婆心的告诫，依旧杜绝不了家中之人好勇斗狠的风气，本庄繁长、善宗次、穴泽氏清、真壁宗干、鹫内秀定等人在往后的日子里依然我行我素。不可否认的是，家中重臣带头冲锋陷阵的确可起鼓舞士气的作用。
在上杉军的本队各部军势于东远江诸郡进行聚集之际，清定还不忘命常陆出身的儒学者山崎秀仙起草檄文：
自古君王临御天下，皆正义居内以制邪魔，邪魔居外以事正义，未闻以邪魔居中而制天下也。自足利氏祚倾移，三筑以蕞尔波州入主雍州，至近畿四国，纵横驰骋，此岂人力，实乃天授。彼时君明臣良，足以纲维天下，然达人志士，尚有杀伐过重之叹。自是以后，乖张暴戾，屡出无名之师军，劳民困人；又如灭人之宗，绝人之祀，至于民众失所；不尊朝廷，幕府，上下相习，恬不为怪，其于父子君臣夫妇长幼之伦，渎乱甚矣。夫人君者斯民之宗主，朝廷，幕府者天下之根本，礼仪者御世之大防，其所为如彼，岂可为训于天下后世哉！及其后架空主家波州细川、京兆细川、足利将军家，失君臣之道，又加以蛮横专权，酷吏毒虐，万民抱怨，于是人心离叛，诸国并起，使我天下之民，死者肝脑涂地，生者骨肉不相保，虽因人事所致，实乃天厌其德而弃之之时也。当此之时，天运循环，近畿气盛，亿兆之中，当降生圣人，驱除天魔，恢复光明，立纲陈纪，救济斯民。今一纪于兹，未闻有治世安民者，徒使尔等战战兢兢，处于朝秦暮楚之地，诚可矜闵。予本越后刈羽三尺微命，因大乱，为众所推，继任家督，后冠坂东副帅，居小田原形式之地，战甲信，平关东，攻东海，败一向，兴上杉，今二十年矣。民稍安，食稍足，兵稍精，控弦执矢，目视我近畿之民，久无所主，深用疚心。予恭承天命，罔敢自安，方欲遣兵西进上洛，拯生民于涂炭，复朝廷，幕府之威仪。虑民人未知，反为我仇，絜家北走，陷溺犹深，故先逾告：兵至，民人勿避。予号令严肃，无秋毫之犯，归我者永安，背我者自窜。盖我近畿之民，天必命我正义之人以安之，邪魔何得而治哉！予恐中土久污膻腥，生民扰扰，故率群雄奋力廓清，志在逐邪魔，除暴乱，使民皆得其所，雪天下之耻，尔民等其体之。故兹告谕，想宜知悉。
鉴于细川晴元的嫡男细川聪明丸仍在三好长庆的手中，清定并没有完全否定现任管领细川氏纲，避免三好长庆狗急跳墙。
当然，清定还命早就暗中臣从上杉家的小川城城主多罗尾光吉、雨乞山城城主藤林保丰二人派遣麾下忍者，对三好家、六角家治下的近江、山城、摄津、大和、和泉、河内等国进行大肆袭扰，尽可能的阻挠三好家、六角家征召军势、调集粮草，从而减轻上杉军上洛的阻力。
而另一方面，足利义辉、三好长庆、六角义贤、朝仓义景、赤松晴政、仁木义视、本愿寺显如等人可没有坐以待毙，他们深知上杉家的兵甲之盛，难以匹敌，便相互之间积极联系，并想方设法的拉拢更多的大名、国人领主们至己方，准备阻遏上杉家三道并进的势头。
尽管足利将军家的权威日益低下，但足利义辉还是与三好长庆、细川氏纲、六角义贤等人联名对西国新崛起的大名毛利元就发去祝贺，希望毛利家能够尽快稳定治下领国，并发兵上洛前来勤王。
为了表示诚意，足利义辉授予了毛利元就御相伴众的家格，以及朱柄伞、涂舆两样免许，直接让其拥有了守护格。
然而，不论伏见宫贞敦亲王（二条晴良岳父）、宽钦法亲王（劝休寺门迹，伏见宫贞敦亲王次男）、尧尊法亲王（妙法院门迹，伏见宫贞敦亲王三男）、任助法亲王（仁和寺门迹，伏见宫贞敦亲王四男）二条晴良、九条稙通、高仓永家、广桥国光、薄以绪等皇室、公卿好说歹说，后奈良天皇就是反对指认上杉清定为朝敌。
加上时任关白近卫前嗣举族经近江朽木谷后逃入若狭，使得朝廷之中的亲上杉家一派公卿顿时失去了主心骨，根本无力阻止亲三好家一派的公卿擅意妄为。